Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd11Q1RNF8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd11Q1RNF8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms