Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rpusd3Q14AI6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd3Q14AI6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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