Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NeblQ0II04 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NeblQ0II04 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms