Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gata4Q08369 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms