Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Calb2Q08331 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms