Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp2Q06649 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms