Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrx2Q06348 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrx2Q06348 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms