Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox8Q04886 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sox8Q04886 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms