Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scg2Q03517 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms