Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uba1Q02053 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms