Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col1a2Q01149 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms