Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1bP97358 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms