Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms