Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Rps28P62858 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms