Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp1bbP56400 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms