Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp1P55194 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp1P55194 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms