Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gdf5P43027 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms