Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkx1-2P42580 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms