Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf1P39428 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf1P39428 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms