Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp4P35123 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp4P35123 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms