Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prim2P33610 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prim2P33610 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim2P33610 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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