Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Saa4P31532 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms