Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms