Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo2P25801 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmo2P25801 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms