Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax3P24610 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax3P24610 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax3P24610 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms