Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RarbP22605 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms