Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrkcaP20444 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms