Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RargP18911 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RargP18911 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RargP18911 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RargP18911 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RargP18911 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms