Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CtsdP18242 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CtsdP18242 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms