Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem254bP0DN90 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem254bP0DN90 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms