Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spta1P08032 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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