Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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