Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P06336 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P06336 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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P06336 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P06336 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P06336 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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