Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PdgfrbP05622 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PdgfrbP05622 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PdgfrbP05622 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PdgfrbP05622 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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