Protein–RNA interactions for Protein: O89086

Rbm3, RNA-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm3O89086 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Rbm3O89086 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbm3O89086 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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