Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CopeO89079 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CopeO89079 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CopeO89079 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms