Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cfdp1O88271 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfdp1O88271 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms