Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ly86O88188 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ly86O88188 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms