Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ldb2O55203 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ldb2O55203 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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