Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ptpn20O55082 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptpn20O55082 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ptpn20O55082 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn20O55082 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptpn20O55082 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptpn20O55082 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms