Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Copb2O55029 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Copb2O55029 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms