Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SlkO54988 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SlkO54988 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SlkO54988 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SlkO54988 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms