Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms