Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn1mwO35599 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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