Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms