Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Ptpn9O35239 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptpn9O35239 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ptpn9O35239 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn9O35239 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms