Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barx2O08686 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Barx2O08686 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Barx2O08686 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms