Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MttpO08601 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MttpO08601 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MttpO08601 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MttpO08601 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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