Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efna5O08543 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms