Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna2d1O08532 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms